Флаг муниципального округа Обуховский представляет собой прямоугольное полотнище с отношением ширины флага к длине — 2:3, воспроизводящее композицию герба муниципального образования муниципальный округ Обуховский в красном, жёлтом и белом цветах.Геральдическое описание герба гласит: «В червлёном (красном) поле над остревидной оконечностью, выложенной серебряными валунами и обременённой тремя червлёными опрокинутыми отвлечёнными узкими остриями (одно, два), завершёнными пятью остроконечными зубцами, средний из которых больше, золотые вписанные положенные накрест поверх деления поля и оконечности морской якорь рымом вверх и, поверх него, пушечный ствол, на котором сидит золотая райская птица вправо с воздетым крылом и распущенным хвостом».